Heybeliada Deniz Lisesi, 1773 yılında kurulmuş ve Türk Deniz Kuvvetleri’ne uzun yıllar subay yetiştiren önemli bir askeri okuldu. Ancak 2016 yılında Türkiye’de gerçekleşen 15 Temmuz darbe girişiminin ardından hükümetin askeri okullarla ilgili aldığı kararlar doğrultusunda kapatıldı. Bu karar, Fetullahçı Terör Örgütü’nün (FETÖ) darbe girişimine karşı alınan önlemler kapsamında askeri okulların Milli Savunma Üniversitesi bünyesinde toplanması amacıyla yapıldı.

Heybeliada Deniz Lisesi’nin kapatılmasıyla, deniz subayı yetiştirme süreci bu üniversitenin Deniz Harp Okulu’na taşındı. Bu çerçevede askeri eğitim sistemi yeniden yapılandırıldı ve askeri okulların yönetimi sivilleştirildi.