Evet, Yeni Yüzyıl Üniversitesi, tercih bursu sağlamaktadır. Özellikle üniversiteyi ilk sırada tercih eden öğrencilere çeşitli oranlarda indirimler sunulmaktadır. Tercih bursu, belirli programlarda farklı oranlarda uygulanıyor. İlk 5 tercih içinde yer alan programlar için indirim oranları genellikle %20 ile %30 arasında değişmektedir​