Sakallı poğaça için peynir tercihi kişisel zevklere ve yöresel tercihlere göre değişebilir. Ancak genellikle beyaz peynir veya lor peyniri sıklıkla tercih edilir. Beyaz peynirin tuzlu tadı ve lor peynirinin hafif kıvamı, sakallı poğaçaya lezzet katar. Ayrıca dilerseniz kaşar peyniri, ezine peyniri veya diğer çeşitler de kullanabilirsiniz, ancak bu durumda poğaçanın tadı ve dokusu değişebilir.